Chromas

파일 형식 지원

Chromas는 Applied Biosystems DNA 시퀀서에서 생성된 .ab1 크로마토그램 파일을 열 수 있습니다. 또한 다른 시퀀서나 데이터베이스에서 생성된 SCF 및 ZTR 형식 파일도 지원합니다.

시퀀스 편집 및 변환

.scf 또는 Applied Biosystems .ab1 형식으로 시퀀스를 저장할 수 있습니다. 시퀀스는 일반 텍스트, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank 또는 GCG 형식으로 내보낼 수 있으며, 프레젠테이션을 위해 기본 번호가 매겨진 형식으로도 저장할 수 있습니다.

시퀀스 분석 도구

클립보드에 일반 텍스트, FASTA 또는 FASTQ 형식으로 시퀀스를 복사하여 다른 애플리케이션에 붙여넣을 수 있습니다. 시퀀스와 크로마토그램을 역방향 및 보완 서열로 변환할 수 있습니다. 정확한 일치 또는 최적 정렬을 통해 부분 시퀀스를 검색할 수 있습니다. 시퀀스와 함께 3개 프레임의 번역을 표시할 수 있습니다.

출력 및 인쇄 기능

크로마토그램을 확대하거나 한 페이지에 맞게 조정하여 인쇄할 수 있습니다. 크로마토그램 섹션의 이미지를 복사하여 문서나 프레젠테이션에 붙여넣을 수 있습니다.

고급 처리 기능

저품질 시퀀스(품질 데이터가 있는 경우) 또는 벡터 시퀀스를 자동으로 제거할 수 있습니다. 배치 처리를 지원하여 형식 변환, 벡터 제거 시퀀스 내보내기, 배치 인쇄 및 원시 데이터 배치 내보내기를 수행할 수 있습니다. Nucleics Pty Ltd의 PeakTrace RP 구성 요소를 사용하여 .ab1 파일의 피크 가독성을 향상시키고 더 많은 고품질 베이스를 추출할 수 있습니다.

다운로드 및 설치 방법

공식 웹사이트에서 Chromas 2.6.6 무료 버전을 다운로드할 수 있습니다. 설치 파일은 exe 형식으로 제공되며, 다운로드 후 파일을 실행하여 설치 마법사의 안내에 따라 설치를 완료할 수 있습니다.

기본 사용법

프로그램을 실행한 후 메뉴 바의 ‘파일’ 메뉴에서 ‘열기’를 선택하여 .ab1, SCF 또는 ZTR 형식의 크로마토그램 파일을 불러올 수 있습니다. 파일이 열리면 중앙 영역에 시퀀스 데이터와 해당하는 컬러 그래프가 표시됩니다. 도구 모음의 버튼을 사용하여 시퀀스를 이동하거나, 특정 기능을 실행할 수 있습니다. 시퀀스를 분석하거나 변환하려면 메뉴 바의 적절한 옵션을 선택하거나 도구 모음의 관련 버튼을 클릭합니다.

이런 경우에 유용합니다

DNA 시퀀싱 실험 결과를 간단히 확인하고 분석해야 하는 연구자나 실험실 기술자에게 유용합니다. 특히 Sanger 시퀀싱에서 단일 시퀀스 읽기를 검토하고, 시퀀스를 다른 형식으로 변환하거나, 클립보드에 복사하여 추가 분석에 사용해야 하는 경우에 적합합니다. 여러 겹치는 시퀀스 읽기를 조립해야 하는 경우에는 ChromasPro 제품을 고려해 볼 수 있습니다.

화면으로 보는 주요 기능

크로마스 프로그램 화면

크로마스 프로그램의 사용자 인터페이스로, 상단에는 파일, 편집, 옵션, 도움말 메뉴가 있는 메뉴 바와 함께 열기, 저장, 내보내기, 인쇄, 다음, 찾기, 강조 표시 기능을 제공하는 도구 모음이 있습니다. 중앙에는 DNA 염기서열(염기: T, G, A, C)과 그에 해당하는 색상 그래프(빨강, 녹색, 파랑, 검정)가 표시된 시퀀스 데이터가 있으며, 각각의 염기 위치에 대한 정확한 위치(160부터 200까지)와 샘플 정보(TRY01#0000403938_241), 기준(175), 품질(59)이 표시되어 있습니다. 하단에는 시퀀스 데이터를 이동할 수 있는 좌우 화살표가 있습니다.